Në shtator 2016, Presidenti Juncker njoftoi krijimin e një Fondi Europian të Mbrojtjes për të ndihmuar Shtetet Anëtare të zhvillojnë dhe të fitojnë aftësitë kyçe strategjike të mbrojtjes më me shpejtësi, së bashku dhe me kosto-efektive. Iniciativa u mirëprit nga drejtuesit e BE-së gjatë takimeve të Këshillit Europian në dhjetor 2016 dhe mars 2017. Fondi Europian i Mbrojtjes është një motor i fuqishëm në mbështetje të secilit prej skenarëve të propozuar. Fondi Europian i Mbrojtjes do të nxisë efikasitetin dhe zhvillimin e BE-së në lidhje me pajisjet dhe teknologjinë e mbrojtjes. Për të arritur këtë, Fondi ka dy variante me struktura të ndryshme ligjore dhe financimi që janë plotësuese dhe po shpërndahen gradualisht: 1. BE do të ofrojë financim të drejtpërdrejtë për hulumtime për produkte dhe teknologji të reja mbrojtëse, të financuara plotësisht nga buxheti i BE; 2. Shtetet Anëtare do të bashkojnë kontributet financiare për të zhvilluar së bashku dhe për të marrë aftësitë e nevojshme të mbrojtjes. BE do të ofrojë bashkëfinancim nga buxheti i BE për të nxitur bashkëpunimin dhe për të nxitur financimin kombëtar. Të dyja fushat do të mbështesin prioritetet e Shteteve Anëtare brenda BE-së, veçanërisht nëpërmjet Planit të Zhvillimit të Kapaciteteve. Komisioni do të ndajë Fondin Europian të Mbrojtjes prej 590 milion € deri në vitin 2020. Fondi nuk është i krijuar për të zëvendësuar investimet e mbrojtjes së Shteteve Anëtare, por për të mundësuar dhe përshpejtuar bashkëpunimin e tyre. Së bashku me kontributet e Shteteve Anëtare për financimin e projekteve të përbashkëta zhvillimore.